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同源重組實(shí)驗(yàn)

簡要描述:同源重組實(shí)驗(yàn)是一種依賴DNA序列相似性(同源臂)的精準(zhǔn)基因編輯技術(shù),通過外源載體與宿主基因組間的序列交換實(shí)現(xiàn)靶向修飾。

  • 更新時(shí)間:2025-07-17
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詳細(xì)介紹

一、定義與分子機(jī)制

同源重組是一種依賴DNA序列相似性(同源臂)的精準(zhǔn)基因編輯技術(shù),通過外源載體與宿主基因組間的序列交換實(shí)現(xiàn)靶向修飾。其核心機(jī)制包括:

  1. 同源臂介導(dǎo)的精準(zhǔn)定位

    • 外源載體兩端設(shè)計(jì)≥1 kb的同源臂(與靶基因側(cè)翼序列一致),引導(dǎo)載體與基因組特異性結(jié)合(避免隨機(jī)插入)。

  2. DNA斷裂修復(fù)與交換

    • 內(nèi)源核酸酶(如Cas9)或自發(fā)損傷誘導(dǎo) 雙鏈斷裂(DSB) → 細(xì)胞啟動同源定向修復(fù)(HDR) → 以載體為模板合成新鏈,實(shí)現(xiàn)基因替換/插入。

  3. 關(guān)鍵分子參與者

    • RecA/Rad51:介導(dǎo)DNA鏈配對與交換

    • BRCA1/2:調(diào)控修復(fù)路徑選擇(HR vs. NHEJ)

生物學(xué)意義:HR是wei一能實(shí)現(xiàn)單堿基至大片段精準(zhǔn)替換的自然修復(fù)機(jī)制,區(qū)別于易出錯的非同源末端連接(NHEJ)。


二、技術(shù)流程與關(guān)鍵步驟

1. 載體設(shè)計(jì)策略

元件功能案例
長同源臂提升重組效率(1-10 kb)小鼠基因敲除常用3 kb臂
正篩選標(biāo)記新霉su抗性(Neo^R)等,篩選重組細(xì)胞中的"Selection"標(biāo)記
負(fù)篩選標(biāo)記HSV-TK(更昔luo韋敏感),淘汰隨機(jī)插入細(xì)胞中的Gancyclovir反選
條件性刪除系統(tǒng)Cre/loxP或FLP/FRT,移除篩選標(biāo)記的LOXP重組

2. 細(xì)胞工程化改造

  • 胚胎干細(xì)胞(ESC)打靶

    1. 電穿孔導(dǎo)入線性化載體 → G418篩選陽性克隆

    2. PCR/Southern驗(yàn)證重組位點(diǎn)(避免隨機(jī)整合)

       
  • CRISPR-HR聯(lián)用

    • Cas9切割靶位點(diǎn) → 同步提供HR模板(效率提升50倍)

3. 動物模型構(gòu)建流程

注:傳統(tǒng)ESC/HR流程需6-12個月,CRISPR-HR可縮短至3個月。


三、應(yīng)用場景與突破案例

1. 疾病模型構(gòu)建

模型類型技術(shù)方案疾病研究價(jià)值
基因敲除小鼠HR替換致病基因?yàn)榻K止子囊性纖維化、癌癥機(jī)制研究
點(diǎn)突變模型HR引入特定SNP(如APOE4)阿爾茨海默癥藥物篩選
人源化模型HR插入人類基因片段(如IL-2)免yi治療評估

2. 生物醫(yī)藥生產(chǎn)

  • 治療性蛋白載體

    • HR將人抗凝xue酶III基因插入山羊β-酪蛋白位點(diǎn) → 乳汁中表達(dá)藥用蛋白(產(chǎn)量>1g/L)

  • 基因治療修復(fù)

    • HR修正β-珠蛋白突變 → 治療β-地中海貧血(臨床前階段)

3. 合成生物學(xué)

  • 染色體工程

    • Cre/loxP介導(dǎo)大片段重組 → 構(gòu)建環(huán)形人工染色體(中的MI系統(tǒng))


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