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ZFNs動(dòng)物模型

簡(jiǎn)要描述:ZFNs動(dòng)物模型:鋅指核酸酶(ZFNs)動(dòng)物模型是利用鋅指核酸酶基因編輯技術(shù)構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型。鋅指核酸酶由鋅指蛋白(ZFP)和核酸酶(FokI)融合而成,鋅指蛋白能夠特異性結(jié)合目標(biāo)DNA序列,而核酸酶則負(fù)責(zé)切割DNA,從而在特定基因位點(diǎn)上引入雙鏈斷裂,誘導(dǎo)細(xì)胞的修復(fù)機(jī)制,實(shí)現(xiàn)基因敲除、敲入或突變。

  • 更新時(shí)間:2025-07-09
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詳細(xì)介紹

一、技術(shù)原理與核心機(jī)制

ZFNs 是第一代可編程基因編輯工具,通過(guò)融合 DNA 結(jié)合域(鋅指蛋白)與 DNA 切割域(FokI 核酸酶)實(shí)現(xiàn)靶向編輯:

  1. 鋅指蛋白結(jié)構(gòu)域

    • 由 30-34 個(gè)氨基酸重復(fù)單元構(gòu)成,每個(gè)單元通過(guò) 第 12、13 位可變殘基(RVDs) 識(shí)別特定堿基:

RVD 類(lèi)型識(shí)別堿基特異性
NIA
NGT
HDC
NNG/A中等
  • 單個(gè)鋅指識(shí)別 3 bp,串聯(lián) 3-6 個(gè)可靶向 9-18 bp 序列。

  1. FokI 切割域

    • 需 二聚化 才能激活切割功能 → ZFNs 需成對(duì)設(shè)計(jì)(左臂/右臂),切割位點(diǎn)位于兩臂結(jié)合位點(diǎn)之間(間隔區(qū) 5-7 bp)。

  2. 編輯機(jī)制

    • 雙鏈斷裂(DSB)→ 細(xì)胞啟動(dòng)修復(fù)路徑:

  • 非同源末端連接(NHEJ) :隨機(jī)插入/缺失(Indels),導(dǎo)致基因敲除。

  • 同源定向修復(fù)(HDR) :需外源修復(fù)模板(如 ssODN),實(shí)現(xiàn)點(diǎn)突變或基因插入。

技術(shù)突破:shou次實(shí)現(xiàn)哺乳動(dòng)物基因組靶向編輯(2005 年),開(kāi)啟精準(zhǔn)基因編輯時(shí)代 。


二、動(dòng)物模型構(gòu)建流程與技術(shù)優(yōu)化

(一)標(biāo)準(zhǔn)化操作步驟

(二)關(guān)鍵技術(shù)參數(shù)優(yōu)化

步驟核心操作創(chuàng)新優(yōu)化
靶點(diǎn)設(shè)計(jì)避開(kāi)高重復(fù)/甲基化區(qū)域,間隔區(qū) 5-7 bp軟件預(yù)測(cè)(ZiFiT)提升結(jié)合效率 
鋅指組裝模塊化串聯(lián)法
  • 3-6 個(gè)鋅指單元串聯(lián)

  • Golden Gate 克?。˙saI/BsmBI) | 6 天完成構(gòu)建,成功率 >80%  |
    表達(dá)載體 | 雙啟動(dòng)子載體(CMV/T7),支持 mRNA 合成與蛋白表達(dá) | 適配多物種(斑馬魚(yú)、小鼠、豬)  |
    遞送方式 | - 受精卵顯微注射 ZFNs mRNA

  • 體細(xì)胞轉(zhuǎn)染 + 核移植(大型動(dòng)物) | mRNA 遞送減少脫靶  |
    修復(fù)增強(qiáng) | 聯(lián)合 ssODN 模板 + NHEJ 抑制劑(SCR7) | HDR 效率提升 3 倍  |


三、多物種應(yīng)用案例與模型優(yōu)勢(shì)

(一)典型物種與疾病模型

物種靶基因疾病模型效率/表型研究?jī)r(jià)值
斑馬魚(yú)golden白化病95% F0 代色素缺失 發(fā)育基因功能篩選
小鼠Rag2/IL2rg免疫缺陷模型雙基因敲除,人源化移植平臺(tái) 腫瘤免yi治療研究
GGTA1異種器guan移植模型敲除 α-Gal 抗原,降低超急性排斥 人源化器官開(kāi)發(fā)
果蠅yellow體色突變生殖系突變率 5.7%(動(dòng)物模型)基因功能保守性驗(yàn)證

(二)不可替代性應(yīng)用場(chǎng)景

  1. 高 GC 區(qū)域編輯

    • 無(wú) PAM 序列限制,可靶向 CRISPR/Cas9 無(wú)法編輯的區(qū)域 。

  2. 低脫靶率需求

    • 治療性編輯中脫靶率 <0.1%(CRISPR 為 1-10%)。

  3. 大型動(dòng)物模型

    • 豬、牛等物種中免疫原性低于 CRISPR 。


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