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基因芯片

簡要描述:基因芯片廣泛用于模式物種的DNA、RNA和表觀遺傳等研究。豐核信息提供SNP芯片、RNA芯片、甲基化芯片分析服務(wù),涵蓋人類和主要模式物種。

  • 更新時間:2022-12-22
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詳細(xì)介紹

項目分類名稱描述
Illumina SNP芯片Human omni-zhonghua-8 beachip包含90萬個位點
Agilent表達(dá)譜芯片Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8×60K V2涵蓋50,599條轉(zhuǎn)錄本信息
Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8×60K涵蓋55,681條轉(zhuǎn)錄本信息
Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8×60K涵蓋30,003條Entrez Gene RNAs
Agilent miRNA芯片Agilent Human miRNA Array V19.0覆蓋2006個人類相關(guān)miRNA
Agilent Rat miRNA Arrary V19.0覆蓋719個大鼠相關(guān)miRNA
Agilent Mouse miRNA Array V19.0覆蓋1247個小鼠相關(guān)miRNA
Agilent 定制miRNA Array V19.0可以定制數(shù)據(jù)庫包含的各個物種的相關(guān)miRNA
Illumina人DNA甲基化芯片服務(wù)IlluminaInfinium Human Methylation450 BeadChip包含了450,000多個甲基化位

 

 數(shù)據(jù)分析(以miRNA芯片分析為例)

 

標(biāo)準(zhǔn)分析

芯片預(yù)處理與標(biāo)準(zhǔn)化;

篩選差異表達(dá)microRNA;

microRNA聚類圖、火山圖以及熱圖等;

microRNA靶基因預(yù)測,基于多數(shù)據(jù)庫整合的靶基因預(yù)測以及上海豐核自主知識產(chǎn)權(quán)的預(yù)測軟件同時識別;

對預(yù)測的microRNA的靶基因進(jìn)行GO富集分析通路富集分析等。

 

個性化分析

1.microRNA網(wǎng)絡(luò)分析:microRNA靶基因失調(diào)網(wǎng)絡(luò);microNRA功能協(xié)同作用網(wǎng)絡(luò)。

2.microRNA與其他芯片整合分析:與lncRNAs芯片結(jié)果聯(lián)合分析(ceRNA Analysis);與mRNA芯片整合分析;與DNA甲基化芯片結(jié)果聯(lián)合分析。

3.與臨床數(shù)據(jù)整合分析

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